Το συγκρότημα του Ενετικού Διοικητηρίου, το λεγόμενο Palazzo, βρισκόταν στο βόρειο άκρο του Καστελλίου, στο τέρμα της οδού Λιθινών. Σήμερα σώζεται το ισόγειο και μέρος του ορόφου, ενώ από την πλευρά της οδού Λιθινών σώζεται το θύρωμα του Αρχείου που φέρει τη χρονολογία 1624. Πλησίον αυτού βρισκόταν και το Οθωμανικό Διοικητήριο με τις Φυλακές, που σήμερα στεγάζουν υπηρεσίες του Πολυτεχνείου Κρήτης.
Αρχηγείο Βενιζέλου / Στρατηγείο Κινήματος Θερίσου
Έτσι ονομάστηκε το αρχηγείο της Επαναστατικής Συνέλευσης του 1905 στο Θέρισο, το οποίο οργάνωσε την ομώνυμη επανάσταση ενάντια στην αυταρχική διακυβέρνηση του Ύπατου Αρμοστή Γεωργίου. Σήμερα το κτίριο έχει μετατραπεί σε μουσείο, στο οποίο εκτίθενται όπλα και άλλα αντικείμενα εκείνης της περιόδου, καθώς και τεκμήρια της επαναστατικής δράσης του Ελευθερίου Βενιζέλου.